در اکثر زخم های معده می توان حضور هلیکوباکترپیلوری را دید. در واقع ضعیف شدن لایه مخاطی محافظتکننده معده توسط هلیکوباکتر می تواند زمینه ساز بروز زخم معده محسوب شود.